平台介绍

开yun体育app官方下载组学中心提供专业的基因组学、转录组学、蛋白组学、表观组学服务,开yun体育app官方下载采用最先进的高通量测序及质谱仪器,致力于为广大生命科学家、医学工作者提供基于多组学技术的科研及临床应用解决方案。有 NovaSeq,Miseq,10X Genomics平台,BD Rhapsody平台,Bruker timsTOF Pro,Orbitrap Exploris 480等平台。中心有一支具备丰富组学研究经验的专业团队,由多位生物信息专家、组学领域的权威学者组成的科研顾问团队,将组学发展的前沿技术与临床科研问题或靶标研究相结合,为客户提供全面、个性化的多组学解决方案。同时拥有 genematrix云平台及sapcatt肿瘤药物靶标发现评分系统。开yun体育app官方下载genematrix分析平台致力于打造一个服务医疗工作者的专业生物信息分析平台。专业团队精心打造多个生物信息分析应用模块,采用可视化交互界面,操作简易流畅,提供多种标准生物信息分析服务,个性化展示分析结果。开yun体育app官方下载SapCatt™(System aiming to Prioritizing Candidate anti-tumor drug target,抗肿瘤药物靶标发现导向的基因标注打分系统),以人类每一个编码蛋白的基因为单位,以清洗后的数据为资源,通过功能、疾病、蛋白特化特征等注释,mRNA/蛋白水平的组织特异性评估,以及基于功能缺失筛选实验的基于细胞活性的基因必需性评估等多方面信息整合挖掘,并开发机器模型预测其可成药性,最终对人类20259个编码蛋白的基因作为抗肿瘤药物靶点的潜在可能性打分,并形成排序。

timsTOF Pro
timsTOF Pro 2
Orbitrap Exploris™ 480
Q Exactive HF-X
BD Rhapsody
DNBelab C4

平台优势

专业、丰富、以客户需求为导向的生信分析

  • 拥有30+人的专业生信分析团队,人均从业5年以上,均具有名校博士学位、欧美留学背景或全球知名企业工作经验,与上海生物信息技术研究中心密切合作
  • 系统的生物标志物、分子分型、药物靶点、基因功能研究等解决方案,助力研究者加快科研成果转化

差异TOP通路
共有TOP通路
Venn图
相关性网络图
两组学差异分子KEGG通路富集
通路可视化图
共有富集通路TOP圈图
相关性圈
共有富集通路TOP网络图
差异TOP分子相关性热图
差异TOP分子 Correlation_Map图
单细胞测序和蛋白组相关性分析
单细胞测序和蛋白组火山图比较
共有差异Go富集
共有差异KEGG富集
TOP差异蛋白在细胞群中的表达热图
TOP差异蛋白细胞群分布
TOP差异蛋白小提琴图
TOP差异蛋白气泡图

与研究型医生长期合作,临床样本处理经验丰富

  • 开yun体育app官方下载面向研究型医生提供技术服务长达20余年,与绝大多数顶级三甲医院已开展多组学合作,积累了一系列针对高水平医学研究的多组学服务方案
  • 每年处理20000+样本,涉及100+种样本类型,实验室技术人员针对临床样本处理经验丰富,并建有细胞类型知识库

平台案例

标题
研究方向
发表期刊
IF
发表时间
发表单位
开yun体育app官方下载助力

METTL3介导的TXNDC5 mRNA m6A修饰通过抑制内质网应激增强宫颈癌进展

METTL3 potentiates progression of cervical cancer by suppressing ER stress via regulating m6A modification of TXNDC5 mRNA

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研究方向:宫颈癌
发表期刊:Oncogene
IF:9.867
发表时间:2022
发表单位:徐州医科大学
开yun体育app官方下载助力:m6A MeRIP-seq

ASIC3-M-CSF-M2巨噬细胞正反馈环在皮肤纤维化发病机制中调节成纤维细胞向肌成纤维细胞的分化

The ASIC3-M-CSF-M2 macrophage-positive feedback loop modulates fibroblast-to-myofibroblast differentiation in skin fibrosis pathogenesis

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研究方向:皮肤纤维化
发表期刊:Cell Death and Disease
IF:9.696
发表时间:2022
发表单位:南京大学
开yun体育app官方下载助力:RNA-seq

基于PDOX小鼠模型探究阿帕替尼通过靶向血栓软骨素1/肌球蛋白重链9抑制胶质母细胞瘤

Apatinib inhibits glioma cell malignancy in patient-derived orthotopic xenograft mouse model by targeting thrombospondin 1/myosin heavy chain 9 axis

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研究方向:胶质母细胞瘤
发表期刊:Cell Death and Disease
IF:9.696
发表时间:2021
发表单位:苏州大学附属第一医院
开yun体育app官方下载助力:RNA-seq

来自血红素加氧酶-1修饰的骨髓间充质干细胞的外泌体递送的miR-124-3p抑制铁死亡以减轻脂肪移植物中的缺血再灌注损伤

miR-124-3p delivered by exosomes from heme oxygenase-1 modified bone marrow mesenchymal stem cells inhibits ferroptosis to attenuate ischemia–reperfusion injury in steatotic grafts

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研究方向:脂肪肝
发表期刊:Journal of Nanobiotechnology
IF:9.429
发表时间:2022
发表单位:南开大学
开yun体育app官方下载助力:外泌体miRNA-seq

通过CTSL和ZBTB7B基因鉴定出新型胃癌高危亚型

A novel high-risk subpopulation identified by CTSL and ZBTB7B in gastric cancer

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研究方向:胃癌
发表期刊:British Journal of Cancer
IF:9.075
发表时间:2022
发表单位:江南大学
开yun体育app官方下载助力:10x Genomics
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